闽发证券成立于1988年5月，创办之始为中国人民银行福建省分行下属企业，注册资本1000万。1996年7月，人民银行下发各级分行与所办证券公司脱钩的通知，闽发证券开始与人民银行脱钩。同年，中国凯利实业公司入主闽发证券。当年12月，闽发证券的资本金增至10919万，凯利公司持有600万股，持股比例54.95％。吴永红任法人代表的福建协盛公司持有1000万股，占股比例约为10％。

    吴永红一度被认为是当地资本运作的“高手”，他的“事业”是通过向泉州市一信用社借款3000万开始实现的。吴永红利用这笔资金，通过反复抽逃，在全国各地注册20多家公司。这些公司互相担保，向银行贷款数亿元，收购闽发证券等企业的股权，一跃成为福建的“资本大鳄”。
 
    1999年3月，凯利公司所持有的闽发证券股权对外转让。同年8月，由吴永红操控的福建协盛、石狮融盛等五家企业趁机受让了凯利公司的全部股份。2000年11月，闽发证券增资扩股至8亿元。吴永红利用闽发证券大股东的身份便利，操纵属于自己的福建协盛、石狮融盛等公司，挪用闽发证券客户保证金、违规银行贷款，虚假“注资”闽发证券，持有其超过51％的股份，完全控制了闽发证券公司。

    为了维持资金链不断掉，闽发证券盲目扩大委托理财，许诺客户保底和高息。近年我国股票市场长期的熊市，使得闽发证券重仓持有的股票难以出手，市值严重缩水。于是，不择手段、不计后果地吸纳更多的高息理财资金成为闽发证券保持“资金链”不断的唯一选择。

    闽发证券的巨额资金主要有五个去向：重仓持有Ａ股市场的几只股票，进行国债交易，炒卖期货，汇出境外炒Ｈ股以及流入吴永红和张晓伟个人控制的公司。闽发证券对深沪交易所某三只股票流通盘的控盘比例一度高达97％、60％和40％，亏损严重。上海证券交易所网站统计资料显示，按国债现货交易量排名，闽发证券在2001年列上交所所有会员单位的第二名，2002年名列第一，2003年8月，国债市场出现震荡，闽发证券损失惨重。闽发证券收购期货经纪公司，自己操作期货买卖，造成巨额亏损。闽发证券的资金还通过地下钱庄等渠道流向境外市场，炒卖Ｈ股。

    2004年４月初，张晓伟因涉嫌经济犯罪被深圳警方带走后，广大投资理财客户纷纷到该公司各营业网点挤提理财资金。由于闽发证券公司严重违规经营、大量挪用客户保证金，造成巨额亏空，无法按时兑付投资理财资金，更加引发了广大投资者的不满。

    2004年10月18日，中国证监会发布通告，称闽发证券属于严重违规经营，为保护投资者和债权人合法权益，决定委托东方资产管理公司对闽发证券进行托管经营。由此，这家挣扎了半年多的问题券商得到了最后的定性和归宿。

    根据东方资产管理公司闽发证券托管经营组的最新统计数字，闽发证券的机构债务为95亿元，个人债务为9.6亿元，扣除15亿多的应收账款，亏损总额高达90亿元。